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Code: OIV 802

Name: SSR-Marker VVMD5

Kategorie: BESONDERHEIT, GENETISCHER MARKER, MERKMALSGRUPPE

Unterkategorie : SONSTIGES, VVMD5, GENETISCHER MARKER

Beschreibung

Größenbereich der Allele: von 221 bis 267 Basenpaare. Bei Verwendung verschiedener Analysemethoden können geringe Abweichungen (1-2 bp) bei den Allellängen auftreten. Das kürzeste Allel, das innerhalb von Genres081 gefunden wurde, wurde willkürlich als „n“ ausgewählt. Sortencode: CF1 steht für das kürzere Allel von Cabernet franc N, CF2 steht für das längere Allel von Cabernet franc N, usw. Wenn ein neues Allel gefunden wird, z. B. „n − 2“, wäre der entsprechende Sortencode „AL1 − 2“. Für die Codierung der Allelgröße von Kultivaren müssen standardmäßig einige Beispielsorten in derselben Analyse untersucht werden. Für die Methode gibt es keine Vorschriften. Jedoch (1) müssen die PCR-Bedingungen für Beispielsorten und zu untersuchende Sorten identisch sein, (2) wird empfohlen, dass in der 3-Schritt-PCR der letzte Verlängerungsabschnitt mindestens 30 Minuten beträgt.